Analisi di Metabarcoding 16S e Metagenomica con Galaxy

Comprendere il complesso mondo delle comunità microbiche è essenziale per la ricerca biologica e medica moderna, ma i dati di sequenziamento grezzi possono sembrare travolgenti. Questo corso basato su testo ti insegna come elaborare e interpretare i dati 16S rRNA utilizzando Galaxy, una potente piattaforma web che non richiede alcuna programmazione. Al termine di questo corso, passerai da principiante a un analista fiducioso in grado di eseguire pipeline metagenomiche standard. Leggerai spiegazioni chiare, comprenderai i concetti biologici sottostanti e imparerai come interpretare i profili tassonomici. Cosa imparerai: Comprendere i concetti fondamentali del sequenziamento 16S rRNA, del metabarcoding e della metagenomica; Navigare nell'interfaccia della piattaforma Galaxy per caricare dati, eseguire strumenti e gestire la cronologia; Eseguire il controllo qualità e la pre-elaborazione sulle letture di sequenziamento grezze per garantire risultati affidabili; Classificare i gruppi tassonomici e confrontare le Unità Tassonomiche Operative (OTUs) con le moderne Varianti di Sequenza dell'Amplicone (ASVs); Interpretare le metriche di diversità ecologica e i grafici di abbondanza tassonomica per trarre conclusioni biologiche. Il corso inizia con la terminologia di base e la teoria alla base del sequenziamento dei geni marcatori prima di guidarti passo dopo passo attraverso una pipeline completa di analisi dei dati. Imparerai a configurare gli strumenti, a concatenare le attività e a risolvere i problemi comuni di qualità dei dati. Questo corso è progettato per principianti, studenti e ricercatori in scienze della vita che desiderano analizzare i dati del microbioma senza scrivere codice da riga di comando. Non è richiesta alcuna esperienza precedente di programmazione o bioinformatica. Inizia oggi il tuo viaggio nell'analisi dei dati microbici e svela i segreti del microbioma.