Molecular Dynamics Simulation: Fundamentals and Implementation (bằng tiếng Anh).

Mô phỏng máy tính đóng vai trò quan trọng trong việc mô phỏg hành vi của nguyên tử và phân tích tính chất vật liệu ở mức độ hiển vi. Chương trình này giới thiệu cơ học cơ bản của động lực học phân tử (MD) và hướng dẫn bạn xây dựng một động cơ mô phủ hoạt động từ đầu. Bạn sẽ khám phá các định nghĩa vật lý cốt lõi, phương pháp tích hợp số, trường lực, và các kỹ thuật hiệu quả tính toán cơ bản. Bạn học được gì: Hiểu các thuật ngữ chính, lực giữa các nguyên tử, và khái niệm nhiệt động lực học trong vật lý tính toán. Thực hiện các tính toán lực bằng mô hình năng lượng tiềm năng Lennard-Jones. Hợp nhất phương trình chuyển động bằng thuật toán Velocity Verlet. Ứng dụng các điều kiện biên tuần hoàn và quy ước hình ảnh tối thiểu. Tối ưu hiệu suất tính toán bằng danh sách láng giềng và các điểm cắt tương tác. Phân tích quỹ đạo mô phỏng để đo nhiệt độ, áp suất và bảo tồn năng lượng của hệ thống. Các tài liệu bắt đầu với các khái niệm cơ bản về vật lý và định nghĩa toán học, dần dần tiến tới thiết kế thuật toán từng bước và thực hiện mã hiệu quả. Chương trình này được thiết kế cho những người mới bắt đầu với khoa học máy tính và lập trình khoa học, những người muốn hiểu về thuật toán mô phỏng từ đầu. Bắt đầu học ngay hôm nay và có cái nhìn thực tế về thiết kế phần mềm động lực học phân tử.