Secuenciación y Ensamblaje Genómico con Teoría de Grafos

La biología moderna depende de la capacidad de leer el ADN, sin embargo, la tecnología aún no puede procesar un genoma completo en una sola pasada. Este curso explora el fascinante desafío computacional de unir millones de pequeños fragmentos genéticos para revelar la imagen completa del genoma de un organismo. Descubrirás cómo la intersección de la biología y la informática nos permite resolver acertijos complejos que son esenciales para la medicina personalizada y la investigación evolutiva. A través de este currículo basado en texto, pasarás de ser un principiante a alguien que comprende la columna vertebral algorítmica de la bioinformática. Aprenderás a representar datos biológicos como estructuras matemáticas y a aplicar patrones lógicos para encontrar la secuencia de nucleótidos más probable. Lo que aprenderás: - Comprender las restricciones biológicas fundamentales de la secuenciación de ADN y la necesidad del ensamblaje de fragmentos. - Aplicar conceptos de teoría de grafos, incluidos los grafos de De Bruijn, para organizar y conectar secuencias genéticas superpuestas. - Explorar la lógica de los algoritmos de fuerza bruta y sus aplicaciones específicas en la secuenciación de pequeñas proteínas y péptidos. - Comparar los enfoques tradicionales de secuenciación de lecturas cortas con los paradigmas computacionales modernos de lecturas largas. - Dominar la terminología de la bioinformática, desde k-mers y contigs hasta caminos eulerianos. - Practicar la resolución de desafíos de ensamblaje a través de ejercicios algorítmicos escritos y escenarios basados en lógica. El curso comienza con la terminología esencial y los fundamentos biológicos del ADN antes de pasar a los métodos específicos basados en grafos utilizados en los laboratorios modernos. Avanzarás a través de explicaciones escritas de la lógica de ensamblaje, seguidas de desgloses paso a paso de los algoritmos que hacen posible la reconstrucción del genoma. Este curso está diseñado para principiantes interesados en la intersección de las ciencias de la vida y la programación. No se requiere experiencia previa en bioinformática o matemáticas avanzadas para comenzar. Adéntrate en el mundo de la biología computacional y comienza a decodificar el lenguaje de la vida.