Introduzione alla mappatura e all'assemblaggio del genoma

Assemblare un genoma completo da milioni di sequenze di DNA frammentate è uno dei puzzle più complessi della biologia moderna. Senza un progetto strutturale, risolvere le regioni ripetitive è quasi impossibile. Questo corso fornisce un'introduzione chiara e graduale alla mappatura del genoma, mostrandoti come le mappe fisiche e genetiche vengano utilizzate per guidare un assemblaggio genomico di alta qualità. Inizierai con la terminologia fondamentale e i principi cardine dell'architettura genomica prima di esplorare metodologie di mappatura sia classiche che contemporanee. Cosa imparerai: 1. Comprendere le differenze critiche tra mappe genetiche, fisiche e ottiche del genoma. 2. Esplorare le tecniche di mappatura tradizionali, incluse le librerie di cloni BAC e la mappatura ibrida da radiazioni. 3. Imparare a utilizzare genomi di riferimento strettamente correlati per creare scaffold e guidare nuovi assemblaggi. 4. Scoprire moderni algoritmi di scaffolding e strategie di integrazione di long-read. 5. Analizzare e convalidare la qualità dell'assemblaggio utilizzando metriche bioinformatiche standard. Questo corso basato su testo è progettato per principianti in bioinformatica, studenti di biologia computazionale e sviluppatori software che passano alle scienze biologiche. Non è richiesta alcuna conoscenza avanzata di genetica. Inizia a leggere oggi per costruire una solida base nella ricostruzione genomica.